Dyrektorowi Instytutu bezpośrednio są podporządkowane następujące komórki organizacyjne Instytutu:
- Biuro Instytutu
- Biuro Zamówień Publicznych
- Biuro Prawne
- Zespół ds. BHP
- Zespół Audytu Wewnętrznego
- Pełnomocnik ds. Jakości
- Oddział Geologii Morza w Gdańsku
- Oddział Świętokrzyski w Kielcach
- Oddział Karpacki w Krakowie
- Oddział Górnośląski w Sosnowcu
- Oddział Pomorski w Szczecinie
- Oddział Dolnośląski we Wrocławiu
Zastępcy dyrektora ds. służby geologicznej są podporządkowane następujące komórki organizacyjne tworzące pion służby geologicznej:
- Dział Koordynacji Zadań Służby Geologicznej
- Program Geologia Złożowa i Gospodarcza
- Program Kartografia Geologiczna i Geologia Regionalna
- Centrum Geozagrożeń
- Program Hydrogeologia i Środowisko
- Program Geologiczne Bazy Danych
- Program Modelowanie Procesów Geologicznych
- Narodowe Archiwum Geologiczne
Zastępcy dyrektora ds. badań i rozwoju są podporządkowane następujące komórki organizacyjne tworzące pion badań i rozwoju:
- Dział Planowania i Rozliczania Badań
- Zakład Surowców Mineralnych i Kopalin Energetycznych
- Zakład Geologii Regionalnej
- Zakład Hydrogeologii i Geologii Środowiskowej
- Dział Wydawnictw
- Zespół ds. Współpracy Międzynarodowej
- Biblioteka i Muzeum Geologiczne
- Zespół Laboratoriów, w skład którego wchodzą:
- Laboratorium Chemiczne
- Laboratorium Analiz w Mikroobszarze
- Centrum Badań Gruntów i Skał
Zastępcy Dyrektora ds. Administracyjno-Ekonomicznych są podporządkowane następujące komórki organizacyjne tworzące pion administracyjno-ekonomiczny:
- Dział Finansowo-Księgowy
- Zespół Controllingu
- Dział Administracyjny
- Dział Informatyki
OBSZARY DZIAŁANIA ODDZIAŁÓW REGIONALNYCH
